巧囊试管又称为微创试管婴儿技术，是一种较为先进的辅助生殖技术。它通过在女性卵巢取出卵子，与男性精子在实验室中进行受精，再将受精卵移植回女性子宫内，帮助不育夫妇实现生育的愿望。

那么，浙江衢州的不孕不育夫妇该去哪里进行巧囊试管呢？

首先，我们需要了解的是，巧囊试管需要进行一系列检查和治疗，包括女性卵巢超声检查、男性精液分析、女性子宫腔镜检查等，以及在实验室中进行的体外受精、胚胎培养和移植等操作。因此，需要前往专业的生殖医院进行诊疗。

在浙江省内，拥有较为先进的生殖医疗技术和设备的医院主要有：

1. 杭州妇产科医院生殖医学中心：该中心建立于1992年，是国内最早开展人类辅助生殖技术的医院之一，现已发展成为集医疗、科研、教学为一体的高水平生殖医学中心。

2. 浙江大学医学院附属第一医院生殖医学中心：该中心是国家卫生计生委认证的国家级生殖医学中心，拥有多项国际领先的生殖医学技术，如冷冻卵子、PGD/PGS等。

3. 浙江省妇幼保健院生殖医学中心：该中心是浙江省唯一一家卫生计生委认证的省级生殖医学中心，具备较为先进的生殖医疗技术和设备。

以上三家医院均在浙江省内享有较高的声誉和知名度，均可提供巧囊试管等高水平辅助生殖技术的诊疗服务。

当然，在选择生殖医院时，需要注意以下几点：

1. 选择正规的医院，避免去一些不合法、不规范的机构进行诊疗。

2. 根据自身情况选择医院，不同的医院有不同的医生团队和诊疗设备，需要根据自身情况选择最适合的医院。

3. 注意医院的服务质量和费用，选择合适的医院进行诊疗。

总之，巧囊试管是一项较为复杂的辅助生殖技术，需要前往专业的生殖医院进行诊疗。在选择医院时，需要注意医院的规模、技术水平、服务质量等方面，选择最适合自己的医院进行诊疗。